河南中医学院药学院关于开展基于简化基因组测序技术(SLAF-seq)进行葶苈子遗传图谱构建单一来源采购意见公示

30.10.2014  19:16

河南中医学院药学院关于开展基于简化基因组测序技术(SLAF-seq)进行葶苈子遗传图谱构建申请采用单一来源方式采购,现公示如下:

一、拟成交供应商的名称: 北京百迈客生物科技有限公司

  二、拟提供货物或服务项目基本情况:完成基于简化基因组测序技术(SLAF-seq)进行葶苈子遗传图谱构建

三、单一来源原因及相关说明

河南中医学院药学院根据目前药用植物葶苈子研究进展,需要分子密度高、特异性高、标记数量可控性强、数据准确性高、后续结合便利的基因组学研究技术。北京百迈客生物科技有限公司的specific-locus amplified fragment sequencing (SLAF-seq)技术是该公司独家拥有的用于基因定位及简化基因组测序的专利技术;与传统分子标记技术相比,SLAF-seq的显著特点是:1.深度测序确保基因分型的准确性。2.简化测序降低了测序费用。3.简化代表文库的酶切设计优化了标记的效率。4.双条形码技术使得能适应超大群体。经过充分地市场调研考察认为,北京百迈客生物科技有限公司为国内唯一能够满足合作要求的公司。故申请采用单一来源采购。

四、其它需要公示的内容:无

公示期限从2014年10月30日起至2014年11月5日止。

潜在政府采购供应商对公示内容有异议的,请于公示期满后2个工作日内以实名书面(包括联系人、地址、联系电话)形式将意见反馈至河南省财政厅政府采购监督管理处(联系电话:联系电话:0371-65808412; 65808416)或河南中医学院药学院(地址:郑东新区龙子湖高校园区,联系人:马利刚,联系电话:18638116431)                                                                       

  2014年10月30日

单一来源采购专家论证意见表

                                                    时间:2014年10月17日

      采购单位

河南中医学院

项目名称

北京百迈客生物科技有限公司

项目金额

专家1论证意见

葶苈子基因组复杂,应用北京百迈客生物科技有限公司的SLAF-seq技术,在基因组学研究中首先对葶苈子的基因组进行生物信息学预测,由于基因组中SNP标记的分布非常丰富,足以选取满足实验要求的标记数量,同时还可以保证标记在基因组中分布的均匀性和特异性,因此分子密度很高,提高中药葶苈子在基因水平的研究,建议采用单一来源采购。

专家姓名:房卫平                          职称:研究员

工作单位:河南省农科院

专家2论证意见

药用植物的基因组序列中,重复序列通常所占比例较大,对这部分序列进行测序的性价比一般很低。但经过SLAF技术的简化,SLAF标签中重复序列所占比例能够大大降低,所以SLAF技术开发方案可以有效避开重复序列,标签序列在基因组中的特异性很高,这非常有利于对中药葶苈子复杂基因组的研究,因此建议采用单一来源采购。

专家姓名:张振中                          职称:教授

工作单位:郑州大学药学院

专家3论证意见

SLAF-seq技术开发的分子标记多数为SNP,以及少量的InDel。获得的每个标记都有序列信息,可以方便地进行引物设计,与性状紧密连锁的标记可以直接应用于分子标记辅助育种、更大群体验证,或BAC文库筛选获得候选功能基因等工作,对于后续基因克隆的研究提供了重要的遗传背景,建议采用单一来源采购。

专家姓名:张骁                          职称:教授

工作单位:河南大学生命科学学院